Друзья! Кто-нибудь въезжал в Россию через местные пункты пропуска (для априграничных территорий)? Как оформить временный ввоз машины на украинских номерах, если там таможенников нет?

А ответ сам собой не напрашивается? Ну, что никак?
И потом, какие "местные" пункты Вы имеете в виду?

Имею ввиду пункты пропуска для пересечения жителями приграничных районов (Межправительственное соглашение от 21 апреля 2006 г). по сути ст.4 через такие местные пункты пропуска не могут перемещаться товары, превышающие беспошлинный ввоз, тк. пошлину платить некому - на этих переходах только погранцы. Как же оформляется ввоз машины, если не заполняется пассажирская таможенная декларация?

Минимизатор, что за соглашение от 21.04.2006 не ведаю, сейчас действует Соглашение между Правительством РФ и Правительством Украины от 08.02.1995 (ред. от 22.12.2006) "О пунктах пропуска через государственную границу между Российской Федерацией и Украиной". Оно никаких "местных" пунктов не предусматривает.
"По жизни" они есть, но ответ на Ваш вопрос очевиден: нет таможенников, нет временного ввоза. Не должны впускать машины через такие пункты.

Раньше знакомые ездили из Белгорода в Харьков через местный пункт пропуска "Журавлевка" возле Нехотеевки (прописаны в Белгородском районе). Последний год не рискуют, т.к. пункт предназначен для жителей Белгородского и Дергачевского районов, и дальше этих районов заезжать нельзя. Однако местные им пользуются, всегда вижу несколько машин у шлагбаума. По слухам, контроль стал строже, пропускают только жителей деревень, непосредственно прилегающих к границе. Не знаю насколько это законно.
К тому же часто эти пункты закрывают в связи с разными эпидемиями.